Versions Compared

Key

  • This line was added.
  • This line was removed.
  • Formatting was changed.

...

Code Block
languagebash
[ldc19002@login4 r-example]$ ls data/
var_ja_100.rds  var_ja_19.rds  var_ja_28.rds  var_ja_37.rds  var_ja_46.rds  var_ja_55.rds  var_ja_64.rds  var_ja_73.rds  var_ja_82.rds  var_ja_91.rds
var_ja_10.rds   var_ja_1.rds   var_ja_29.rds  var_ja_38.rds  var_ja_47.rds  var_ja_56.rds  var_ja_65.rds  var_ja_74.rds  var_ja_83.rds  var_ja_92.rds
var_ja_11.rds   var_ja_20.rds  var_ja_2.rds   var_ja_39.rds  var_ja_48.rds  var_ja_57.rds  var_ja_66.rds  var_ja_75.rds  var_ja_84.rds  var_ja_93.rds
var_ja_12.rds   var_ja_21.rds  var_ja_30.rds  var_ja_3.rds   var_ja_49.rds  var_ja_58.rds  var_ja_67.rds  var_ja_76.rds  var_ja_85.rds  var_ja_94.rds
var_ja_13.rds   var_ja_22.rds  var_ja_31.rds  var_ja_40.rds  var_ja_4.rds   var_ja_59.rds  var_ja_68.rds  var_ja_77.rds  var_ja_86.rds  var_ja_95.rds
var_ja_14.rds   var_ja_23.rds  var_ja_32.rds  var_ja_41.rds  var_ja_50.rds  var_ja_5.rds   var_ja_69.rds  var_ja_78.rds  var_ja_87.rds  var_ja_96.rds
var_ja_15.rds   var_ja_24.rds  var_ja_33.rds  var_ja_42.rds  var_ja_51.rds  var_ja_60.rds  var_ja_6.rds   var_ja_79.rds  var_ja_88.rds  var_ja_97.rds
var_ja_16.rds   var_ja_25.rds  var_ja_34.rds  var_ja_43.rds  var_ja_52.rds  var_ja_61.rds  var_ja_70.rds  var_ja_7.rds   var_ja_89.rds  var_ja_98.rds
var_ja_17.rds   var_ja_26.rds  var_ja_35.rds  var_ja_44.rds  var_ja_53.rds  var_ja_62.rds  var_ja_71.rds  var_ja_80.rds  var_ja_8.rds   var_ja_99.rds
var_ja_18.rds   var_ja_27.rds  var_ja_36.rds  var_ja_45.rds  var_ja_54.rds  var_ja_63.rds  var_ja_72.rds  var_ja_81.rds  var_ja_90.rds  var_ja_9.rds

GNU Parallel approach (no longer working, use openmpi and parallel functions in the R code instead)

We can execute the same task using GNU Parallel. All the files to be created here will be placed in the same directory as the ones we created for the job array approach.

...